在1995年夏天上映的「侧耳倾听」中,吉卜力尝试了一个新的制作群组合。宫崎骏负责制作、编剧、绘分镜表,而曾在「萤火虫之墓」、「魔女宅急便」及「岁月的童话」中担任动画导演的近藤喜文,则出马挑战导演一职。此外,吉卜力也试着在影片中的各个部份加入了最近的数位技术。在「岁月的童话」完成之后,吉卜力开始着手制作他们的第十一部影片,「幽灵公主」,此片将在1997年上映。这部由宫崎骏执导的电影将会应用非常多的电脑科技,这是吉卜力的一大挑战。为了应付这个新的挑战,吉卜力设立了一个专门的CG小组,也购置了一切CG所需的设备。同时,他们也邀请了一位Nippon Television Network的CG导演加入「幽灵公主」制作小组,这位导演以前也曾在「平成狸合战」中参加制作。
1995年,吉卜力的另一项重要工作是宫崎骏为恰克和飞鸟(CHAGE & ASKA)的新作歌曲“On Your Mark”制作了这一部长六分多钟的Music Movie(音乐电影),在“Super Best 3”放映。作品中充满了飞行的镜头,特别是少女从奔驰的汽车上滑行飞向天空的场面,有一种听轻松音乐时的解脱感。六分钟的音乐电影,相信制作成本一定不低,当中宏伟的人造地底科幻世界,以及地表一望无垠的草原,一定令观众看得目瞪口呆。而且按照推断这个故事拍成长剧也一定非常吸引,可惜到目前为止还没有看见这个故事有一个较为完整的版本。
《幽灵公主》是吉卜力的第十一部影片,这部由宫崎骏执导的电影应用了非常多的电脑科技,这是吉卜力的一大挑战。为了应付这个挑战,吉卜力设立了一个专门的CG小组,更斥资一亿日元购置了一切CG所需的设备。同时,他们也邀请了一位Nippon Television Network的CG导演铃木敏夫加入到影片的制作小组,此前铃木也曾参与到《百变狸猫》的制作过程中。电脑技术的运用使原来只有2D的平面影像变得更加具有深度。从1980年起,宫崎骏就开始筹划一部有关“少女爱的物语”的影片,1995年终于全心投入制作中,耗时两年,胶片总数多达13.5万张,成本总计20亿日元。《幽灵公主》于1997年7月12日开始公映,至次年2月共上映184天,票房收入179亿日元,平均“日进斗金”。全国观众达三千万人次。主题歌由久石让作曲,宫崎骏作词,米良美一演唱,同名单曲专辑当年内发行38.3万张,其它周边产品不计其数,更带动前作《龙猫》、《风之谷》、《侧耳倾听》、《On Your Mark》的动画录影带销量进入年度前六名。该片成为日本当时有史以来第一卖座电影,吉卜力又一次改写了历史。